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NEB助力新型冠状病毒 2019-nCoV 快速诊断与研究

2020/3/20 13:19:14      点击:


    在 21 世纪的第一个十年,非典爆发。2003 年 7 月的数据显示,SARS 病毒在全球 27 个国家造成了 8096 例感染病例,774人死亡。十年后,MERS 病毒引起的中东呼吸综合征,又在 27 个国家带来了 1728 例确诊病例,夺走了 624 条生命。


    2020 年关将至,冠状病毒再一次汹涌袭来。2019 年 12 月 30 日,武汉市卫生健康委员会医政医管处发布《关于做好不明原因肺炎救治工作的紧急通知》,通知称武汉部分医疗机构陆续出现不明原因肺炎病人,临床表现均表现为病毒性肺炎或肺部感染。2020 年伊始,在科研人员的快速应对下,检出一种新型冠状病毒,并获得该病毒的全部基因组序列。世界卫生组织正式将造成武汉不明原因肺炎疫情的新型冠状病毒命名为:2019-nCoV。


  十七年前抗击 SARS 的领军人物钟南山院士以 83 岁高龄再次挂帅出征,于昨日接受央视采访时指出,目前已能肯定新型的冠状病毒能“人传人”。几个小时前,武汉市卫健委也发布消息,指出“武汉共有 15 名医务人员确诊为新型冠状病毒感染的肺炎病例”。钟南山院士表示:当前防控最有效的办法就是早发现、早诊断、早治疗、早隔离。


  从首例新型肺炎报告后的第 14 天,世界卫生组织(WHO)宣布,已收到中国分享的从武汉不明原因病毒性肺炎病例中检测到的新型冠状病毒基因序列信息。到基因序列公布后的 1~2 天里,若干诊断公司根据病毒的 RNA 序列,先后宣布完成了新型冠状病毒检测试剂盒的开发。这些均得益于目前先进的测序手段及快速的诊断方法。当前,对冠状病毒的诊断测试包括 RT-PCR,实时逆转录 PCR(rRT-PCR),逆转录环介导的等温扩增(RT-LAMP)以及实时 RT-LAMP。1 月 17 日,WHO 针对发布了新型冠状病毒诊断方案:Diagnostic detection of 2019-nCoV by real-time RT-PCR(Charité Virology, Berlin, Germany)。

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   近期,快速的诊断方案使各地新增病例得到快速确诊,这增加了大家对疾病的警惕和防护,也可使流行病学监测高效进行,以采取有效的预防措施和实施适当的抗病毒治疗。对于新型冠状病毒的深入研究和快速诊断方案,NEB 作为分子生物学领域的头部供应商,能够提供从病原体核酸提取,到二代测序建库、RT-qPCR 和 RT-LAMP 诊断试剂的一整套完整解决方案。


01  核酸提取






货号

名称

规格

T2010S

Monarch Total RNA Miniprep Kit

50 preps


  • 全能:集样本保存、细胞裂解、gDNA 去除为一体
  • 广泛适用:适用于培养细胞、血液、哺乳动物组织和病毒,及难裂解样本,如细菌、酵母和植物。
  • 高质量:A260/280 和 A260/230 比值均≥1.8,高 RIN 值和极低 gDNA 残留(gDNA 去除柱和 DNase I)。
  • 高效:可纯化总 RNA 包含小 RNA,通过改变结合条件可以选择性地筛选<200 nt 的 RNA,包含 miRNA、5S rRNA 和 tRNA。
  • 下游应用:提取纯化得到的 RNA 可用于 RT-qPCR、cDNA 合成、RNA-seq、Northern blot 分析等下游实验。


02   RT-qPCR



货号

名称

规格

E3005E

Luna Universal One-Step RT-qPCR Kit

2500 rxns

E3005L

Luna Universal One-Step RT-qPCR Kit

500 rxns

E3005S

Luna Universal One-Step RT-qPCR Kit

200 rxns

E3005X

Luna Universal One-Step RT-qPCR Kit

1000 rxns

E3006E

Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR Kit

2500 rxn

E3006L

Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR Kit

500 rxns

E3006S

Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR Kit

200 rxns

E3006X

Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR Kit

1000 rxns

M0372L

Antarctic Thermolabile UDG

500 units

M0372S

Antarctic Thermolabile UDG

100 units

M0280L

Uracil-DNA Glycosylase (UDG)

5,000 units

M0280S

Uracil-DNA Glycosylase (UDG)

1,000 units


  • 使用简便:每个产品对应一种应用,方便的预混液形式及易操作的实验步骤
  • 性能优异:Luna 系列产品经过严格的优化及检测以确保特异性、灵敏度、精确性及可重复性
  • 防污染:预混液中包含 dUTP,qPCR 前使用 NEB 的南极热敏 UDG (NEB#M0372)或 UDG(NEB#M0280)进行预处理以防止产物残留污染。
  • 避免加样误差:肉眼可见的蓝色惰性示踪染料,避免加样失误
  • 室温建立体系:温启动的反转录酶和热启动 Taq 酶共同提升了反应特异性和稳定性
*已有大型诊断公司采购 Luna 系列的 E3006 进行新型冠状病毒检测试剂盒的研发。


03   等温扩增

聚合酶链反应(PCR)是特定 DNA 扩增技术,已被广泛应用。然而,PCR 需要反应混合物在不同温度之间重复循环才能实现扩增,因此,在分子生物学和分子诊断实验室中还有其他序列特异性扩增方法,也像 PCR 技术一样常被使用。这些替代方法通常不需要改变反应温度,因此被称为等温扩增。等温扩增方案多种多样,并各具优势。NEB 提供品类齐全的等温扩增系列产品,全面满足等温扩增检测试剂盒的研发及生产。


货号

名称

规格

M0275L

Bst DNA Polymerase, Large Fragment

8,000 units

M0275M

Bst DNA Polymerase, Large Fragment

8,000 units

M0275S

Bst DNA Polymerase, Large Fragment

1,600 units

M0275V

Bst DNA Polymerase, Large Fragment

800 units

M0328S

Bst DNA Polymerase, Full Length

500 units

M0374L

Bst 3.0 DNA Polymerase

8,000 units

M0374M

Bst 3.0 DNA Polymerase

8,000 units

M0374S

Bst 3.0 DNA Polymerase

1,600 units

M0537L

Bst 2.0 DNA Polymerase

8,000 units

M0537M

Bst 2.0 DNA Polymerase

8,000 units

M0537S

Bst 2.0 DNA Polymerase

1,600 units

M0538L

Bst 2.0 WarmStart DNA Polymerase

8,000 units

M0538M

Bst 2.0 WarmStart® DNA Polymerase

8,000 units

M0538S

Bst 2.0 WarmStart DNA Polymerase

1,600 units

M0330L

Bsu DNA Polymerase, Large Fragment

1,000 units

M0330S

Bsu DNA Polymerase, Large Fragment

200 units

E1700L

WarmStart LAMP Kit (DNA & RNA)

500 rxns

E1700S

WarmStart LAMP Kit (DNA & RNA)

100 rxns

M1800L

WarmStart Colorimetric LAMP 2X Master Mix (DNA & RNA)

500 rxns

M1800S

WarmStart Colorimetric LAMP 2X Master Mix (DNA & RNA)

100 rxns

M0249L

RecA

1,000 ug

M0249S

RecA

200 ug

M2401S

ET SSB

50 ug

M0300L

T4 Gene 32 Protein

500 ug

M0300S

T4 Gene 32 Protein

100 ug


04  反转录


针对 RNA 病毒检测的反转录步骤,NEB 提供高灵敏度、适应不同温度、以及更低起始量的一系列反转录酶及试剂盒。


货号

名称

规格

E5310S

OneTaq RT-PCR Kit

30 rxns

E5315S

OneTaq One-Step RT-PCR Kit

30 rxns

E6300L

ProtoScript First Strand cDNA Synthesis Kit

150 rxns

E6300S

ProtoScript First Strand cDNA Synthesis Kit

30 rxns

E6560L

ProtoScript II First Strand cDNA Synthesis Kit

150 rxns

E6560S

ProtoScript II First Strand cDNA Synthesis Kit

30 rxns

M0253L

M-MuLV 

Reverse Transcriptase

50,000 units

M0253S

M-MuLV 

Reverse Transcriptase

10,000 units

M0277L

AMV 

Reverse Transcriptase

1,000 units

M0277S

AMV 

Reverse Transcriptase

200 units

M0368L

ProtoScript II 

Reverse Transcriptase

10,000 units

M0368S

ProtoScript II Reverse Transcriptase

4,000 units

M0368X

ProtoScript II 

Reverse Transcriptase

400,00 units

M0380L

WarmStart RTx Reverse Transcriptase

250 rxns

M0380S

WarmStart RTx Reverse Transcriptase

50 rxns

S1230S

Random Primer 6

1.0 A260 units

S1254S

Random Primer 9

1.0 A260 units

S1316S

Oligo d(T)18 mRNA Primer

5.0 A260 units

S1327S

Oligo d(T)23 VN

1.0 A260 units

S1330S

Random Primer Mix

100 µl (60 µM)


05  二代测序


2003 年 4 月 14 日,SARS 病毒样本在华大基因实验室完成 RNA 测序,此时距离首例感染病例的发现已过去了 100 多天。而此次,距离首例新型肺炎报告仅 14 天,WHO 已收到新型冠状病毒基因序列信息。这得益于 16 年间二代测序技术的蓬勃发展和中国医疗工作者的不断开拓。
NEB 公司拥有十年开发二代测序建库产品的经验,NEBNext 系列产品不断在简化工作流程、最小起始量、更高的文库产量和质量等方面进行优化,助力更多科研工作者针对病毒样本进行深入研究。
NEBNext 单细胞/超低起始量 RNA 文库制备试剂盒(NEB #E6420)可直接从单个细胞或 2 pg-200 ng 的 RNA 构建成全长转录本的高质量文库。优化的cDNA 合成 & 扩增模块(NEB #E6421)包含模板转换,可单管完成从细胞裂解到 cDNA 的全部实验流程。同时该试剂盒中的 NEBNext Ultra™ II FS DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7805、E6177)可用于逆转录后的病毒 cDNA 文库构建,并提供 DNA 片段化试剂,将 DNA 片段化、末端修复和加 dA 尾优化到一步,可在单管中完成,省去了繁琐的纯化步骤,进一步防止病毒样品损失。


货号

名称

规格

E6420S/L

NEBNext 单细胞/超低起始量 RNA 文库制备试剂盒

24/96 rxns

E6421S/L

NEBNext 单细胞/超低起始量 cDNA 合成 & 扩增模块

24/96 rxns

E7805S/L

NEBNext Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒 - 含片段化酶

24/96 rxns

E6177S/L

NEBNext Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒 - 含片段化酶/含纯化磁珠

24/96 rxns


温馨提示:病毒流感高发期,请务必注意个人卫生,勤洗手,保持居住环境的清洁,多开窗通风,尽量少去人多密集的公共场所,出门记得戴口罩。





北京百灵克生物科技有限责任公司
公司地址:北京海淀区永定路88号长银大厦9C05
咨询热线:010-58895880/58896088
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